Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019

Abstract

Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab ® . Se seleccionaron seis aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo. Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia. Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256µg/mL. La tipificación por Diversilab® indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfr G además de optrA y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos y tres variantes de optrA : ST16 ( optr A-2), ST476 ( optrA-5 ) y ST618 ( optrA-6 ). El entorno genético de los aislamientos optrA-2 (ST16) presentó el segmento imp B, fex , optrA , asociado a plásmido, mientras que en dos aislamientos ( optrA-6 y optrA-5 ) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn 6674-like . Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optr A presentan una alta diversidad genética, con diferentes clones y variantes de optr A relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles.