Identifikasi Virus Penyebab Penyakit Kerdil pada Tanaman Padi di Sukamandi, Jawa Barat

Abstract

Penyakit tanaman padi yang disebabkan oleh virus merupakan kendala penting bagi produksi beras di Indonesia. Penelitian dilakukan untuk menentukan insidensi penyakit kerdil di daerah Sukamandi, Kabupaten Subang, Jawa Barat, mengidentifikasi penyebab penyakit kerdil dengan metode RT-PCR dan perunutan gen protein selubung. Berdasarkan hasil pengamatan di lapangan, insidensi penyakit kerdil tergolong rendah (0.01–10.52%) selama pengamatan periode November–Desember 2014. Gejala penyakit yang ditemukan, yaitu gejala kerdil hampa, gejala kerdil rumput, dan gejala campuran kerdil hampa dan kerdil rumput. Pita DNA spesifik gen protein selubung Rice ragged stunt virus (RRSV) dan Rice grassy stunt virus (RGSV) berhasil diamplifikasi. Analisis sikuen nukleotida menunjukkan bahwa RRSV dan RGSV isolat Subang memiliki homologi tertinggi berturut-turut dengan RRSV isolat Vietnam, Filipina, dan Thailand (97.1 %), dan RGSV isolat Longan, Vietnam (95.8 %).