Identificación molecular de bacterias asociadas a plantas ornamentales producidas in vitro

Abstract

En plantas ornamentales reproducidas in vitro en viveros del Centro de Desarrollo Tecnológico Tezoyuca perteneciente al FIRA, se detectaron síntomas de necrosamiento en hojas y tallo durante la fase de adaptación. El objetivo de este trabajo fue identificar el agente etiológico de la enfermedad en hojas y tallos necrosados de los explantes en la etapa de aclimatación, los cuales se sembraron en condiciones asépticas para detectar el crecimiento de microorganismos. Se obtuvieron doce colonias de bacterias de dichas muestras, a las que se les extrajo ADN con un kit comercial. Los iniciadores de la reacción de PCR fueron rP2 y fD1. Todos los productos de PCR se secuenciaron y se analizaron con el programa Chromas Lite®. Utilizando la búsqueda de homología por BLAST se identificaron las siguientes bacterias: Kosakonia oryzae, Pectobacterium cypripedii, Burkholderia tropica, Serratia marcescens, Pantoea dispersa, Erwinia rhapontici, Pantoea dispersa y Pantoea agglomerans. De éstas, Pectobacterium cypripedii, Pantoea agglomerans y Erwinia rhapontici son de importancia fitosanitaria. No se hicieron pruebas de patogenicidad con estos microorganismos.