Diversität und Merkmale kultivierbarer Bakterien in Böden

Abstract

Nach der taxonomischen Zugehörigkeit der kultivierbaren Bacteria in Böden (sie stellen etwa 0,1% bis 20% der mikroskopisch sichtbaren Zellen) entfällt die überwiegende Mehrzahl auf die „Vier Großen“ Phyla: Actinobacteria > Firmicutes > Proteobacteria > Bacteriodetes. Im Allgemeinen gehören die meisten kultivierbaren Bakterienisolate zu den Proteobacteria (∼ 54%), Actinobacteria (∼ 23%), Firmicutes (∼ 14%) und Bacteriodetes (∼ 6%). Somit unterscheiden sich die häufigsten isolierbaren Bacteria aus Böden in der Reihenfolge deutlich von der allgemeinen Häufigkeit der kultivierbaren Bacteria. Wenn die Häufigkeit der 16S-rRNA und 16S-rRNA-Gensequenzen in den Datenbanken (Kap. 4 und 7) einmal als Indikator für die taxonomische Zugehörigkeit der dominanten Boden-Bacteria zugrunde gelegt wird, dann würden Vertreter der Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Verrucomicrobia und Bacteriodetes die dominanten Vertreter stellen (Janssen 2006). Dieses Ergebnis kann zwar nicht als repräsentativ für die taxonomische Zugehörigkeit der häufigsten Bacteria gelten, doch gibt es Aufschluss über die Diversität von bisher nichtkultivierbaren Bacteria in Böden (Kap. 7).