SARS-CoV-2: Virology and Microbiological Diagnostic Tools

Abstract

Ağır solunum yetersizliği ile seyreden “Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)”un etkeni olan “Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus 2 (SARS-CoV-2)”, Coronavirus ailesi içinde yer alan yeni bir türdür. HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1, MERS-CoV ve SARS-CoV’dan sonra insanları enfekte edebilen yedinci koronavirüs olan SARS-CoV-2 betakoronavirüs cinsi içinde yer almaktadır. Koronavirüsler, 65–125 nm çapında zarflı, tek zincirli, pozitif polariteli RNA virüsleridir. RNA virüsleri içinde en büyük genom yapısına sahiptirler. Bu özellikleri nedeniyle konak genomuna entegre olmadan, kendi viral genomlarını kalıp olarak kullanarak replike olurlar. Replikasyon aşamasında, genomun yapısında bulunan gen bölgeleri yapısal ve yapısal olmayan proteinleri kodlar. Yapısal proteinler virionun bir araya getirilmesi ve enfeksiyon patogenezinde rol almaktadır. Virüsün tipik şeklini veren Spike proteini (S), konak hücreye tutunmayı sağlayan özel bağlanma bölgesi içerir. Konak hücrede, virüsün hedefi kalp, akciğerler, böbrekler ve gastrointestinal sistemde bulunan anjiyotensin dönüştürücü enzim-2 reseptörüdür. Hücre içinde gelişen tüm replikasyon döngüsü sitoplazmada gerçekleşir. SARS-CoV-2 viral yapısı ve enfeksiyon patogenezi hakkındaki bilgiler, SARS-CoV ve MERS-CoV ile ilgili yapılan çalışmalara dayanmaktadır. SARS-CoV-2’ye özgü, detaylı araştırmalar virüsün yapısı ve patogenezinin tam olarak aydınlatılmasını sağlayacaktır.