Analisis Molecular Docking Senyawa Garcinia Mangostana L Sebagai Kandidat Anti SARS-CoV-2

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi dari senyawa-senyawa alami  Garcinia mangostana L.  atau kulit manggis sebagai kandidat anti-SARS-CoV-2 dengan menghambat  main protease  (M Pro )   COVID-19. Dalam penelitian ini digunakan metode  molecular docking  dengan program Autodock Vina dan di-visualisasi-kan dengan program Discovery Studio. Kemampuan inhibitor dinilai berdasarkan energi bebas ikatan (ΔG), Konstanta inhibisi (Ki), kompleks ligan-reseptor dan ikatan hidrogen. Validasi dilakukan dengan  re-docking  ligan alami X77 terhadap protein target (6W63) dengan hasil RMSD 1.082 Å. Simulasi  docking  dari 3 ligan uji diperoleh 1 senyawa dengan afinitas terbaik yang menghasilkan ΔG = -7.8 kcal/mol dan Ki = 1,91 µM. Berdasarkan hasil penelitian, diantara ligan uji senyawa  beta-mangostin  paling berpotensi sebagai kandidat anti-SARS-CoV-2 dengan afinitas terbaik.