Association of GHR|AluI gene polymorphism with body weight parameters in Grati-PO cattle

Abstract

Gen growth hormone receptor (GHR) merupakan anggota dari famili reseptor sitokin kelas I yang penting dalam regulasi pertumbuhan termasuk pada sapi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa asosiasi antara gen GHR|AluI dan parameter bobot badan pada populasi sapi PO Grati. Sebanyak 304 sampel darah sapi PO dikoleksi dari kandang percobaan Loka Penelitian Sapi Potong yang dilengkapi dengan 304 data fenotipiknya. Sampel darah diisolasi menggunakan zymo extraction kit. Deteksi keragaman gen GHR menggunakan metode polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) dengan enzim pemotong AluI. Indikator polimorfisme meliputi frekuensi genotipe, frekuensi alel, Hardy-Weinberg Equilibrium, heterozigositas pengamatan (Ho), heterozigositas harapan (He), polymorphism information content (PIC) dan jumlah alel efektif (Ne). Analisis asosiasi dilakukan menggunakan linier mixed model. Performans bobot lahir, bobot sapih, bobot setahun dan bobot umur 18 bulan masing-masing adalah 25,4 ± 0,2kg; 113,8 ± 2,3 kg;159,9 ± 2,7 kg; dan 213,7 ± 3,6kg. Hasil analisis asosiasi signifikan (p<0,05) pada bobot sapih, bobot setahun dan bobot umur 18 bulan. Gen GHR berpotensi sebagai penanda genetik untuk sifat pertumbuhan dan dapat digunakan sebagai kandidat penanda genetik untuk seleksi sapi PO-Grati.