Screening and identification of the 16S rRNA sequence phylogeny of fibrinolytic bacteria in shrimppaste

Abstract

Petis merupakan salah satu produk fermentasi yang terbuat dari hewan laut seperti ikan atau udang. Enzim fibrinolitik pada makanan fermentasi dari hewan laut sudah banyak ditemukan. Penapisan bakteri penghasil enzim fibrinolitik menggunakan enam petis dari industri rumah tangga yang berbeda. Isolasi sampel diperoleh dari uji proteolitik pada media Skim Milk Agar dan uji fibrinolitik dengan fibrin plate. Identifikasi bakteri ditunjukkan dengan pewarnaan Gram dan metode sekuensing 16S rRNA. Sampel dilarutkan dalam NaCl 0,9% sampai pengenceran 10-7 lalu diinokulasikan pada media SMA dan diinkubasi pada suhu 37ºC selama 24 jam. Seluruh sampel memiliki aktivitas proteolitik yang ditunjukkan dengan terbentuknya zona jernih disekitar koloni bakteri. Terdapat tujuh belas isolat bakteri proteolitik yang digunakan untuk uji aktivitas fibrinolitik dengan metode fibrin plate lalu diinkubasi pada suhu 37ºC selama 24 jam. Ketujuh belas isolat menunjukkan hasil positif terhadap aktivitas fibrinolitik dengan indeks fibrinolitik terbesar pada bakteri P3c. Isolat bakteri P3c diidentifikasi menggunakan metode sekuensing sekuensing gen 16S rRNA. Hasil dari identifikasi, bakteri yang memiliki aktivitas fibrinolitik terbesar adalah Bacillus flexus.