MOLECULAR CHARACTERIZATION OF HAIRY FLEABANE USING RAPD

  • SILVA D
  • AGOSTINETTO D
  • VARGAS L
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Abstract

ABSTRACT With the increase of glyphosate resistance evolution in hairy fleabane, the knowledge of genetic diversity is essential to assist in the weed management. The objective was to characterize the genetic diversity of glyphosate resistant Conyza species in Rio Grande do Sul. Hairy fleabane biotype seeds were collected in fields of glyphosate-resistant soybean, generating seedlings used for extracting DNA from the leaves to perform a genetic diversity analysis, using the RAPD technique. The DNA was used in polymerase chain reaction and DNA fragments were assessed for polymorphism bands in electrophoresis. Biotypes were identified as Conyza bonariensis and microcephala varieties. In molecular analysis, among 25 primers RAPD, eight were reproducible generating polymorphisms of high intensity for the separation of biotypes. Cluster analysis revealed five groups, which had a genetic similarity of 53%. The results indicate that all known biotypes are of the same species, but exhibit different varieties. RAPD presents itself as an important tool for characterizing Conyza species.RESUMO Com a evolução do aparecimento de casos de buva resistente ao glyphosate, o conhecimento da diversidade genética é importante para auxiliar no manejo dessa planta daninha. Assim, o objetivo deste estudo foi caracterizar a diversidade genética de plantas de Conyza spp. resistentes ao glyphosate ocorrentes no Rio Grande do Sul. Foram coletadas sementes de biótipos de buva em áreas de cultivo de soja geneticamente modificada resistente ao glyphosate, das quais foi extraído DNA das folhas para análise de diversidade genética, utilizando-se a técnica de RAPD. O DNA foi usado na reação de polimerase em cadeia, e os fragmentos de DNA foram avaliados quanto ao polimorfismo das bandas em eletroforese. Os biótipos foram identificados como Conyza bonariensis variedades bonariensis e microcephala. Na análise molecular dos 25 primers testados, oito apresentaram polimorfismos reprodutíveis e de alta intensidade para a separação dos biótipos. A análise de agrupamento revelou cinco grupos, os quais apresentaram similaridade genética de 53%. Os resultados indicam que todos os biótipos identificados são da mesma espécie, porém apresentam variedade distinta. A técnica de RAPD apresenta-se como importante ferramenta para caracterização de espécies de Conyza.

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SILVA, D. R. O., AGOSTINETTO, D., & VARGAS, L. (2016). MOLECULAR CHARACTERIZATION OF HAIRY FLEABANE USING RAPD. Planta Daninha, 34(3), 433–442. https://doi.org/10.1590/s0100-83582016340300004

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