El análisis filogenético: métodos, problemas y perspectivas

Abstract

In the last century, Darwin and Haeckel were the first to propose the phylogenetic trees. The first phylogenies were made intuitively, but in the fifties several researchers tried to propose rules for their reconstruction. The evolutionary school in tended to use the principies of evolution, the numerical (or pheneticist) school advanced the "distance methods", while the cladistic school proposed the "parsimony method". The UPGMA and the Neighbor:Joining are the more commonly used distance methods. The parsimony method tries to find the tree that requires the smallest number of changes. There are other methods that take in to account the evolutionary forces, like the maximum likelihood (Felsenstein, 1981). In this paper we discuss some of the problems associated to phylogeny reconstruction, the advantages of the different methods and of some of the computer available programs, and finally we offer a perspective on the uses of the phylogenies.En el siglo pasado, Darwin y Haeckel fueron los primeros en proponer árboles filogenéticos. Las primeras filogenias fueron construidas intuitivamente, pero a partir de los años cincuenta diferentes investigadores intentaron dar reglas para su reconstrucción. La escuela evolucionista propuso utilizar los principios de la evolución , la escuela de la taxonomía numérica (o fenética) dio origen a los "métodos de distancia", mientras la escuela cladista propone el "método de parsimonia". Los métodos de distancia más utilizados son el UPGMA y el Neighbor-Joining. Los métodos de parsimonia tratan de encontrar el árbol que requiere el menor número de cambios. Existen otros métodos que toman en cuenta a las fuerzas evolutivas, como el de máxima verosimilitud (Felsenstein, 1981). En este artículo discutimos los problemas asociados a la reconstrucción filogenética, las ventajas de los diferentes métodos, y de algunos de los programas de computadora para la reconstrucción filogenética; presentamos asimismo una perspectiva de los usos de las filogenias.