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Abstract

Uma das técnicas mais utilizadas para o estudo de sequências gênicas é o alinhamento sequencial. Esta técnica visa a comparação de sequências biológicas (gênicas ou proteicas) na tentativa de fazer um “pareamento” entre seus caracteres (bases nitrogenadas ou aminoácidos). A utilização desta ferramenta é abrangente e pode ser aplicada à a identificação de motifs conservados, e de suas estruturas secundárias e terciárias; construção de árvores filogenéticas, cladogramas e dendogramas; busca em bancos de dados (data-mining) e busca de sequências homólogas. O alinhamento é amplamente abordado em aulas de genética e bioinformática de diversos cursos, constando na ementa de várias disciplinas. Ao ensinar este conteúdo, é imprescindível que o professor, após uma abordagem teórica, utilize uma ferramenta de alinhamento para uma prática computacional.