Identifikasi molekuler lepidopteran predator Coccidae pada tanaman kopi di Sukabumi

Abstract

Ngengat predator yang diduga berpotensi untuk dikembangkan sebagai agens pengendali hayati kutu tempurung (Coccidae) ditemukan di Sukabumi, Jawa Barat. Kutu tempurung merupakan hama pada tanaman kopi (Coffea spp.). Namun demikian, informasi nama spesies ngengat predator tersebut, belum pernah dilaporkan di Indonesia, khususnya secara molekuler. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies predator melalui identifikasi secara molekuler. Penelitian dilaksanakan mulai Desember 2022 sampai dengan September 2023. Predator diambil dari pertanaman kopi yang terserang kutu tempurung di Sukabumi. Identifikasi sampel dengan teknik PCR terhadap fragmen DNA mitokondria COI dilakukan di laboratorium Departemen Proteksi Tanaman IPB, Bogor. Dari hasil pengolahan data sekuensing, diperoleh sekuen DNA dengan panjang fragmen 658 pb. Sekuen DNA sampel predator memiliki kemiripan dengan spesies Autoba rubra, dengan tingkat homologi 95,44% (GenBank) dan 95,39% (BOLD Systems). Berdasarkan analisis filogeni, sampel juga berkerabat dekat dengan Mataeomera sp. dan A. dispar. Hasil penjajaran sekuen DNA menunjukkan bahwa sampel dan empat voucher spesies A. rubra yang ada di database GenBank memiliki variasi sebesar 7,58%. Berdasarkan hasil identifikasi secara molekuler, dapat disimpulkan bahwa ngengat predator yang memangsa kutu tempurung pada tanaman kopi di Sukabumi merupakan spesies A. rubra.A predatory Lepidoptera that has the potential to be a biological control agents of the soft scale insect (Coccidae) on coffee plants (Coffea spp.) was found in Sukabumi, West Java. However, information regarding the species name of predatory Lepidoptera has never been reported in Indonesia. Literature for morphological identification of this predatory Lepidoptera species is limited. Therefore, this study was conducted to identify predator species molecularly. Predators were collected from coffee plantations that were infested by soft scale in Sukabumi, West Java. Identification using the PCR procedures of mitochondrial COI gene was carried out in the laboratory. The results show that the sample DNA sequences (629 bp) has a similarity level of 95.67% (GenBank) and 95.37% (BOLD Systems) to the Autoba rubra Hampson species. Based on phylogeny analysis, the sample is also closely related to Mataeomera spp. The DNA sequences alignment variation of sample and four species voucher A. rubra in the GenBank database was 7.58%. Therefore, it can be concluded that the predatory Lepidoptera that preys on soft scale insect on coffee plants in Sukabumi are most closely related to the species A. rubra.