Seqüenciamento e variabilidade do fragmento genômico de Xylella fastidiosa amplificado pelos iniciadores RST31/33

Abstract

Xylella fastidiosa é agente causal de diversas doenças de importância econômica como a clorose variegada dos citros (Citrus spp.) (CVC), mal de Pierce da videira (Vitis vinifera), escaldadura da ameixeira (Prunus salicina) e requeima do cafeeiro (Coffea arabica). A seqüência nucleotídica do fragmento genômico, específico de X. fastidiosa, amplificado pelo par de iniciadores RST31/33 foi determinada para 38 isolados de citros e para isolados de videira, cafeeiro e ameixeira objetivando avaliar o nível de polimorfismo entre isolados e a identidade genômica do fragmento. Não foi observado polimorfismo de seqüência nucleotídica entre isolados de citros, mas foi detectado polimorfismo entre isolados de citros e de videira, cafeeiro e ameixeira. A presença do sítio de clivagem RsaI, que distingue isolados de citros e videira de isolados de ameixeira e outras espécies arbóreas, foi identificada em um isolado de ameixeira proveniente dos EUA mas não em outro proveniente do Brasil.Xylella fastidiosa causes several plant diseases of economic importance such as citrus (Citrus spp.) variegated chlorosis (CVC), Pierce's disease of grapevine (Vitis vinifera) and leaf scorch of plum (Prunus salicina) and coffee (Coffea arabica). The nucleotide sequence of the genomic fragment, specific to Xylella fastidosa, amplified by the pair of primers RST 31/33, was determined for 38 isolates from citrus and for isolates from grapevine, coffee and plum in order to assess the level of sequence polymorphism of this fragment among isolates, as well as its genomic identity. Sequence polymorphism was not observed among isolates from citrus, but was detected among isolates from citrus and from grapevine, coffee and plum. The presence of a RsaI restriction site, which distinguishes isolates from citrus and grapevine from plum and other arboreal species, was identified in a North American isolate from plum but not in a Brazilian one.