Las técnicas de secuenciación masiva en el estudio de la diversidad biológica

Abstract

Resumen Las técnicas de análisis genómico que se basan en la secuenciación masiva han supuesto una revolución en la última década no sólo en biomedicina o agronomía, sino también en el estudio de la diversidad biológica. Las plataformas de secuenciación de segunda y tercera generación que vienen a complementar a la tradicional secuenciación por el método Sanger, permiten analizar un gran número de individuos obteniendo una profundidad de secuenciación signi-ficativa de sus genomas o transcriptomas. Así, aunque todavía de manera incipiente, se vienen realizando estudios sobre la flora y fauna silvestre a escala poblacional, con especial énfasis en la determinación de patrones adaptativos frente a los cambios ambientales. En la presente re-visión se describe la situación actual de las plataformas de secuenciación masiva, señalando sus ventajas y limitaciones para el análisis en organismos no modelo, para a continuación de-tallar las bases de dos de las técnicas más populares que se benefician de la secuenciación ma-siva (RAD-seq y RNA-seq) y señalar algunos ejemplos de su uso para el estudio de la diversidad biológica. Palabras clave: genoma, RAD-seq, RNA-seq, secuenciación masiva, SNP, transcriptoma. Abstract High-throughput sequencing based on genomic analysis techniques have not only revolutionized the fields of biomedicine or agronomy, but also the research into biological diversity. 7 Secuenciación masiva y diversidad biológica Munibe, Cienc. nat. 64, 2016 • pp. 7-31 • Donostia/San Sebastián • Las técnicas de secuenciación masiva en el estudio de la diversidad biológica. Massive sequencing techniques in the study of biological diversity.