Predição de função de proteínas através da extração de características físico-químicas

  • De Oliveira Rodrigues T
  • Leijôto L
  • Brandão P
  • et al.
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Abstract

Com a conclusão do projeto Genoma, o número de novas proteínas descobertas tem crescido, mas devido ao alto custo e da demora dos processos de descoberta da função de proteínas, apenas uma pequena parcela das mesmas tem sua função conhecida. Este trabalho apresenta uma metodologia para predição de função de proteínas através da extração de características de suas estruturas, presentes no banco de dados StingDB, a utilização da Transformada Discreta do Cosseno, a codificação da estrutura primária, o balanceamento de classes e a utilização de Máquinas de Vetores de Suporte. Os valores médios obtidos para a precisão, sensibilidade, acurácia e especificidade foram, respectivamente de 80\%, 71%, 74% e 77%. Os resultados foram comparados com outros trabalhos da literatura, e mostraram um aumento de 10% na taxa de precisão.

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De Oliveira Rodrigues, T. A., Leijôto, L. F., Brandão, P. C. O., & Nobre, C. N. (2015). Predição de função de proteínas através da extração de características físico-químicas. Revista de Informática Teórica e Aplicada, 22(1), 29. https://doi.org/10.22456/2175-2745.49242

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