KAJIAN FILOGENETIK ULAR SANCA BATIK (Malayopython reticulatus) LOKALITAS JAWA BERDASAR SEKUEN GEN SITOKROM B

Abstract

Ular sanca batik (Malayopython reticulatus) lokalitas Jawa memiliki fenotip yang berbeda antara lokalitas Jawa Barat, Jawa Tengah dan Jawa Timur. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui filogenetik ular sanca batik (Malayopython reticulatus) lokalitas Jawa berdasar sekuen gen sitokrom B. Sebanyak 15 ekor ular sanca batik dewasa sehat, jenis kelamin jantan dan betina (5 dari Jawa Barat, 5 dari Jawa Tengah dan 5 dari Jawa Timur) digunakan dalam penelitian ini. Sampel darah sebanyak 1 mL dikoleksi dari masing-masing ular dan ditampung dalam tabung eppendorf ber-EDTA, kemudian dikirim ke Laboratorium Biokimia FKH UGM untuk dilakukan isolasi total Deoxyrybo Nucleic Acid (DNA), desain primer, amplifikasi DNA dengan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan Elektroforesis Gel Agarose. Sequencing DNA dilakukan di PT Genetika Science Jakarta. Data hasil sekuensing gen sitokrom B dianalisis untuk penentuan filogenetik dengan metode Neighbor joining (MEGA v. 5.0). Hasil sekuensing gen sitokrom B, Malayopython reticulatus lokalitas Jawa Barat, Jawa Tengah dan Jawa Timur memiliki keseragaman panjang nukleotida 819 bp. Hasil filogram menggunakan metode Neighbor joining menunjukkan Malayopython reticulatus lokalitas Jawa Tengah dapat dibedakan dari lokalitas Jawa Barat, sedang lokalitas Jawa Timur ada yang mirip lokalitas Jawa Tengah dan ada yang mirip lokalitas Jawa Barat. Malayopython reticulatus lokalitas Jawa Barat dan beberapa lokalitas Jawa Timur filogenetiknya lebih dekat dengan Malayopython reticulatus Gene Bank dibanding lokalitas Jawa Tengah. Dapat disimpulkan bahwa Malayopython reticulatus lokalitas Jawa memiliki panjang nukleotida 819 bp.  Malayopython reticulatus lokalitas Jawa Barat dan sebagian lokalitas Jawa Timur filogenetiknya lebih dekat dengan Malayopython reticulatus Gene Bank. Ada perbedaan filogenetik Malayopython reticulatus lokalitas Jawa Tengah dengan lokalitas Jawa Barat dan Jawa Timur. Perlu penelitian lebih lanjut dengan jumlah sampel yang lebih banyak dan variasi asal-usul lokalitas.