Keragaman genetik cendawan entomopatogen Metarhizium anisopliae (Metsch.) berasal dari tanah pertanaman kelapa sawit berdasarkan penanda RAPD

Abstract

Metarizhium anisopliae (Metsch.) adalah cendawan entomopatogen yang umum menyerang kumbang Oryctes rhinoceros (Linnaeus). Cendawan ini adalah salah satu yang berpotensi dalam mewujudkan pengelolaan hama berkelanjutan karena ramah terhadap lingkungan. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi cendawan M. anisopliae dari berbagai sampel tanah pertanaman kelapa sawit dan melihat keragaman genetiknya berdasarkan penanda random amplification of polymorphic DNA (RAPD). Metode yang dilakukan dalam penelitian ini adalah identifikasi M. anisopliae secara morfologi dan molekuler (ITS), dan pengujian keragaman genetik menggunakan penanda RAPD. Lima belas isolat M. anisopliae berasal dari lima belas perkebunan rakyat kelapa sawit di Sumatera Utara diuji keragaman genetiknya. Berdasarkan karakter morfologinya semua isolat diidentifikasi sebagai Metarhizium sp. Hasil sekuens dengan primer ITS menunjukkan semua isolat M. anisopliae yang yang berasal dari tanah memiliki homologi 85–99% dengan strains M. anisopliae dan M. brunneum rujukan dari database bank gen National Center Biotechnology Information (NCBI). Delapan primer RAPD menghasilkan 39 pita yang mana 38 pita (98,44%) dari pita tersebut polimorfik. Kisaran jarak genetik atau ketidaksamaan genetik antara isolat M. anisopliae adalah 0,051 sampai 0,520%. Analisis pengelompokan RAPD menggunakan metode Neighbour-Joining Tree yang membentuk tiga kelompok.Metarizhium anisopliae (Metsch.) is an entomopathogenic fungus that attacks Oryctes rhinoceros (Linnaeus). This fungus is one of the potential bioagents that is environmentally friendly. The purpose of this study was to isolate the fungus M. anisopliae from various oil palm plantation soil samples and to see its genetic diversity based on RAPD markers. The method used in this research is the morphological and the molecular identification of M. anisopliae (ITS), and genetic diversity testing using RAPD markers. Fifteen isolates of M. anisopliae isolated from 15 oil palm plantation sites in North Sumatra were examined for their molecular diversity. On the basis of morphological characteristics, all isolates were identified as M. anisopliae. The result of sequencing with the ITS primer showed that all isolates of M. anisopliae isolated from soil had a 85–99% homology of with M. anisopliae and M. brunneum reference strains from gen bank database National Center Biotechnology Information (NCBI). Eight RAPD primers generated 39 scorable bands which 38 (98,44%) of them were polymorphic. Clustering analysis was performed based on RAPD profiles using Neighbour-Joining Tree method that formed 3 groups.